Mg2+ ion |
Site type |
Inner-sphere ligands |
Outer-sphere ligands |
---|
PDB ID |
Mg2+ ID |
Oph |
Or |
Ob+Nb |
Water |
Other |
Pout |
Rout |
Bout |
1yjn |
08001 |
fac-3Oph |
A:02483(OP2), C:02533(OP2), C:02534(OP2) |
|
|
03626, 07761, 09177 |
|
U:02484 |
G:02482, A:02532 |
|
1yjn |
08002 |
cis-2Oph·Ob |
A:02483(OP1), C:02534(OP1) |
|
G:0627(O6) |
04345, 07739, 07740 |
|
U:02535 |
U:0625 |
U:0626 |
1yjn |
08003 |
fac-3Oph |
A:0876(OP2), G:0877(OP2), A:02624(OP1) |
|
|
03679, 09020, 09832 |
|
|
|
|
1yjn |
08004 |
Oph·Ob |
A:0459(OP1) |
|
G:0456(O6) |
03798, 07746, 09048, 09785 |
|
A:0455, A:0460, A:0477 |
|
A:0455 |
1yjn |
08005 |
mer-3Oph |
A:01836(OP1), U:01838(OP1), A:01839(OP2) |
|
|
03622, 07762, 07763 |
|
G:01837 |
|
A:01839 |
1yjn |
08006 |
poly-nuclear Mg2+ site |
U:0821(OP2), C:0822(OP2), G:0854(OP1) |
|
|
03628, 03768, 09816 |
|
G:0856, U:0855 |
|
|
1yjn |
08007 |
mer-3Oph |
U:0832(OP2), A:01839(OP1), A:01840(OP2) |
|
|
03366, 07751, 09006 |
|
G:0833 |
|
|
1yjn |
08008 |
mer-3Oph |
U:0919(OP1), C:02464(OP1), A:02465(OP1) |
|
|
03641, 07755, 07840 |
|
G:02466 |
|
|
1yjn |
08009 |
cis-2Oph |
G:02611(OP1), A:02612(OP1) |
|
|
03752, 07423, 07756, 07757 |
|
G:02094, G:02093 |
|
|
1yjn |
08010 |
Mg2+ bound by non-RNA |
G:0836(OP1), U:02615(OP1) |
|
|
03857, 09367, B8825 |
GLN:B230(OE1) |
G:02616 |
|
|
1yjn |
08013 |
cis-2Oph |
G:0877(OP1), G:02623(OP1) |
|
|
03654, 03667, 07770, 09019 |
|
C:02475, A:02624 |
|
G:0885 |
1yjn |
08014 |
Oph·Or |
G:02537(OP2) |
G:02102(O5') |
|
03672, 04180, 07737, 09033 |
|
G:02102, G:02481 |
C:02536, A:02101 |
G:02480, G:02481, A:02101 |
1yjn |
08016 |
fac-3Oph |
A:01504(OP1), A:01678(OP1), C:01679(OP2) |
|
|
07764, 07765 |
|
|
|
|
1yjn |
08017 |
Oph·3Pout |
G:0456(OP2) |
|
|
03633, 03961, 07747, 09420, C8661 |
|
A:0455, G:0458, U:0457 |
|
|
1yjn |
08018 |
cis-2Oph |
A:01291(OP1), G:01292(OP2) |
|
|
03226, 03624, 07458, 07842 |
|
C:0910, U:0909 |
|
G:0911, G:01292 |
1yjn |
08019 |
Oph·2Pout |
A:02011(OP2) |
|
|
04167, 07233, 07766, 07767, 07768 |
|
A:01941, G:01891 |
U:01890 |
G:01891, C:01892 |
1yjn |
08020 |
Oph·2Pout |
C:01830(OP1) |
|
|
07750, 07769, 09121, 09124, 09198 |
|
U:01831, A:01842 |
G:01828 |
G:01828, G:01832 |
1yjn |
08021 |
Oph·3Pout |
G:02304(OP2) |
|
|
03650, 03651, 07753, 07754, 09969 |
|
A:02301, A:02303, A:02305 |
|
A:02305, G:02304, U:02306 |
1yjn |
08022 |
cis-2Oph |
G:02097(OP2), G:02540(OP1) |
|
|
03888, 07758, 09109, 09462 |
|
A:02095 |
A:02096 |
G:02097 |
1yjn |
08023 |
cis-2Oph |
G:02617(OP2), G:02618(OP2) |
|
|
03639, 03838, 07774, 07775 |
|
|
G:02616 |
G:02618 |
|